得了生殖器皰疹以後，一定要進行正規的治療，同時要了解一些治療的誤區問題，隻有進行正規良好的治療，才能取得最佳的治療作用，如果不注意治療的完整性，容易出現生殖器皰疹反復發作，導致病情嚴重，常見的治療方法最主要的就是局部治療方法和全身的治療方法，另外平時的生活治療也很重要。
1.局部療法：
原則為幹燥，收斂，保護患部，防止繼發感染，可外塗2%龍膽紫溶液，或選用10%次沒食子酸鉍(代馬妥dermatol)，氧化鋅油膏或泥膏，紫草生地榆油膏，0.5%新黴素軟膏，或0.25%~0.1%皰疹凈(IDU)軟膏，5%皰疹凈二甲基亞砜溶液(用於皮膚皰疹)等，對顏面部者亦可用10%醋酸鋁或鋅銅合劑。
2.全身治療：
治療原則其一使感染的HSV不能活化，甚至消滅病毒;其二調節免疫，防止再發，可用阿昔洛韋靜滴或口服，麗珠威口服，幹擾素肌註，白細胞介素Ⅱ肌註，我們在治療復發性生殖器皰疹時，使用四醫大生物技術中心產的幹擾素300萬單位肌註，每日一次，10次為一療程，共三個療程，適當配合使用白細胞介素Ⅱ或利百多或靈桿菌素，95%的病人不復發。
3.病原療法
(1)阿昔洛韋(無環鳥苷)：可選擇性地抑制病毒復制，減少新損害的發生，減輕疼痛，縮短創面愈合及排毒時間，對原發性或初次發作的GH，0.2g，口服，5次/d，連用7～10天;對復發性GH，0.2g，口服，5次/d，連用5天，或0.4g，口服，3次/d，連用5天，或0.8g，口服，2次/d，連用5天，輕症患者1～1.6g/d，分5次口服，連用5～7天;重症病人15mg/(kg·d)，靜註，連用5～7天，脫水和腎功能不全者慎用，近年來， 伐昔洛韋(萬乃洛韋)，泛昔洛韋(famciclorvir)等阿昔洛韋(ACV)的衍生物也用於本病的治療。
(2)膦甲酸鈉：對有TK基因缺陷的耐ACV病毒感染者，可用膦甲酸鈉40mg/kg，靜註，每8小時1次，至痊愈。
(3)利巴韋林(三氮唑核苷)：0.6～0.8g/d，口服或肌註，連用5～7天。
(4)α，β及γ-幹擾素(α，β，γ-IFN)：100萬u/d，共5～7天。
(5)聚肌胞 2～4ml，肌註，隔天1次，連用5～7天。
(6)阿糖胞苷(cytarabine)等也可用。
4.免疫療法
Straus等采用gD-2疫苗接種，即重組HSV-2在CHO細胞表達的糖蛋白D，誘導的抗原特異性中和抗體相當於或超過GH患者產生的水平，100μg/次，2個月後重復1次，與對照組相比，復發次數明顯減少，對減輕症狀和預防感染也有效。