陰莖發育不良和陰囊後陰莖
陰莖發育不良極其罕見(迄今文獻報道僅36例)，可伴有其他泌尿生殖器官異常和下腸道異常，由外生殖器胚胎發育障礙所致。
目前還沒有令人滿意的藥物或手木療法使她的陰莖具有完美的功能，所以應該果斷決定將她的性別確定為女性，用手術切除她的睪丸，並進行人工陰道成形術以在青春期開始使用雌激素，從而促進她形成女性習慣和第二性征。
陰囊後陰莖(即『陰囊後陰莖』)的出現，與一開始的陰莖發育不良非常相似。
文獻報道陰囊後陰莖15例。
這類患者還可能伴有尿道異常：陰莖解剖上可能正常，但位置異常，也可能反映出不同程度的胚胎發生障礙。
升氏對於某些疾病，可以通過手術將陰莖恢復到陰囊前部。
第二，雙陰莖
陰莖勃起是一種罕見的男性外生殖器異常。
據估計，每550萬名新生兒中隻有一例雙少男症。
Wilson1973在1973年的一篇綜述中引用了108例典型的躁鬱症患者。
隻有一個陰莖有功能，有尿道。
因此，隻有在進行詳細的泌尿系統檢查並明確尿道口後，才應進行適當的手術治療。
第三，小陰莖
雖然很多父母都很在意孩子陰莖的大小，但其實陰莖並不常見。
嚴格來說，陰莖是在胚胎中形成的，主要表現為大小異常，而不是形狀異常。
陰莖尿道口正常，可以分辨出陰莖的頭和體。
睪丸大小可能正常。
陰莖的病因尚不清楚，但有時似乎與懷孕後第4至9個月期間雄激素分泌不足有關。
在某些情況下，陰莖也可能出現在其他疾病中，表現為下丘腦或垂體異常(如無腦兒、先天性垂體缺失、普-威利綜合征、卡爾曼綜合征和梅乎早克爾綜合征)、睪丸異常或染色體異常。
其他陰莖患者也可見於健康嬰兒。
鑒於陰莖過小對成長中的孩子的心理影響，局部塗抹1%睪酮乳膏約3~6個月是一種可取的方法，常可使陰莖長到中等大小。
如果這種方法療效不理想，可以考慮註射睪吵頃散酮治療3個月。
據報道，這種療法可以促進陰莖生長，但它隻有短期的促進骨骼生長和輕度男性化的效果。
但需要強調的是，兒童期應盡可能避免雄激素過多，因為雄激素治療導致的骨和髖關節過早愈合，可能會限制日後長骨的生長。
錢和馬祖爾最近報道，應用青少年柔性塑料陰莖給一個9歲的陰莖患者成功植入。
這一手術使孩子能夠在腳上小便，從而增強了他的自尊心。