生殖器皰疹的症狀比較多，對於普通人來說，了解這些症狀有助於平時更好的預防這種傳染性比較強的性病，但患者發病以後會導致私處出現灼燒感，常會導致一些全身性的症狀表現，比如說發熱頭痛，尿頻，尿急，腰痛的症狀，當病症比較嚴重的時候，還會引起排尿困難，會導致尿瀦留等等。
1、外陰患部先有灼熱感
生殖器皰疹hsv感染後平均約4～5日，外陰患部先有灼熱感，旋即發生成群丘疹，可為一簇或多簇，繼之形成水皰。
數日後演變為膿皰，破潰後形成糜爛或淺潰瘍，自覺疼痛，最後結痂自愈，病程約2～3周。
2、伴有低熱頭痛等全身症狀
生殖器皰疹導致的皮損多發於男性的包皮、龜頭、冠狀溝和陰莖等處，偶見於尿道口;女性則多見於大小陰唇、陰蒂、陰阜、子宮頸等處，亦見於尿道口。
原發性生殖器皰疹，往往伴有全身不適，低熱、頭痛等全身症狀，局部淋巴結腫大。
該病常復發，復發性生殖器皰疹較原發者輕，損害小，往往無全身症狀。
3、排尿困難、尿痛
男性後期炎症波及尿道、膀胱時，可出現排尿困難、尿痛、尿頻、嚴重者可發生尿瀦留等現象。
此外，還可能有其他症狀同時出現，如發熱、全身不適、頭痛、頸項強直、腦膜炎和骶部神經系統功能不全。
男性同性戀可出現肛門直腸hsv-2感染，其發病率僅次於淋球菌所致的肛門直腸炎，臨床表現為肛門直腸疼痛、便秘、分泌物增加和裡急後重，肛周可有皰疹性潰瘍，乙狀結腸鏡檢常見直腸下段粘膜充血、出血和潰瘍。